085238-生物工程
0710Z2-计算生物学

生物信息学

2010-09--2013-09   德国波恩大学   自然科学博士学位
2004-09--2007-06   云南大学   理学硕士学位
2000-09--2004-06   云南大学   工学学士学位

   

   

   

2018-07~现在, 中国科学院昆明植物所, 正高级工程师
2016-11~2018-06,云南省烟草农业科学研究院, 专业技术人员
2013-09~2016-10,德国科隆大学, 博士后
2010-09~2013-09,德国波恩大学, 自然科学博士学位
2009-07~2010-07,中国科学院北京基因组所, 助理研究员
2008-08~2009-06,中国科学院中德马普计算生物学伙伴所, 研究助理
2007-07~2008-07,中国科学院昆明动物所, 研究实习员
2004-09~2007-06,云南大学, 理学硕士学位
2000-09~2004-06,云南大学, 工学学士学位

   

生物信息学

   

   

   

   

（1） Integrative genomic profiling of large-cell neuroendocrine carcinomas reveals distinct molecular subtypes of high-grade neuroendocrine lung tumors, Nature Communications, 2018, 第 12 作者
（2） Copy number analysis and inference of subclonal populations in cancer genomes using Sclust, Nature Protocols, 2018, 第 1 作者
（3） Two mouse models reveal an actionable PARP1 dependence in aggressive chronic lymphocytic leukemia, Nature Communications, 2017, 第 9 作者
（4） Transcriptomic profile of tobacco in response to Tomato zonate spot orthotospovirus infection, Virology Journal, 2017, 第 2 作者
（5） Comprehensive genomic profiles of small cell lung cancer, Nature, 2015, 第 4 作者
（6） netClass: an R-package for network based, integrative biomarker signature discovery, Bioinformatics, 2014, 第 1 作者
（7） Network and data integration for biomarker signature discovery via network smoothed T-statistics, PLoS ONE, 2013, 第 1 作者
（8） Prognostic gene signatures for patient stratification in breast cancer - accuracy, stability and interpretability of gene selection approaches using prior knowledge on protein-protein interactions, BMC Bioinformatics, 2012, 第 1 作者
（9） Biomarker gene signature discovery integrating network knowledge, Biology, 2012, 第 1 作者

   

   

（ 1 ） 发展机器学习模型用于智能植物志的物种分类和鉴定, 主持, 部委级, 2019-01--2021-12
（ 2 ） 植物基因组从头组装和遗传变异分析平台的构建, 主持, 市地级, 2018-10--2020-09
（ 3 ） 大尺度区域生物多样性格局与生命策略, 参与, 部委级, 2018-10--2022-12